Informacije

1.3: Mjerenje udaljenosti - biologija

1.3: Mjerenje udaljenosti - biologija


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Većina objekata koji se susreću u biologiji kreću se od ispod milimetra do metara u dužinu ili prečnik.

  1. Nabavite ljudsku kost. Pažljivo rukujte. Konsultujte zglobni kostur kako biste saznali lokaciju kosti.
    1. Iz kog dijela tijela je kost?
    2. Koje je naučno ime ove kosti?
  2. Izmjerite dužinu kosti u centimetrima (cm).
    1. Prevedite svoje mjerenje u metre (m) i milimetre (mm).
  3. Koristite metar za mjerenje dužine ruke ili noge, palca.
    1. Prevedite svoje mjerenje u centimetre (cm) i milimetre (mm).

Definiranje nagiba

Nagib je u suštini nagib ili nagib zemljišta. Strma padina se odnosi na oštar nagib, blag nagib na blagi nagib. Strme, pošumljene padine na slici 1.1 u kontrastu su s blažim nagibom riječnog puta dok teče između njih.

Vozeći se autoputem, možda ćete vidjeti putokaz koji glasi "6% stepena" ili "strmog nagiba". The razred puta je, u suštini, njegov nagib. Znak na slici 1.2 pokazuje da se put spušta na nagibu od šest posto ili šest posto postotni nagib.

Slika 1.2. Putokaz koji označava nagib od 6%, ili nagib od 6%.

Nagib od šest posto znači da se visina ceste mijenja za 6 stopa za svakih 100 stopa horizontalne udaljenosti (slika 1.3).

Slika 1.3. Put se penje na nagibu od 6 posto. Cesta dobija 6 stopa u nadmorskoj visini za svakih 100 stopa horizontalne udaljenosti. Imajte na umu da je dužina samog puta duža od 100 stopa.

Matematički, nagib se definiše kao „ porasti iznad trči ” (ili uspon podijeljen s trčanjem), u kojem je uspon jednak promjeni elevacije, a trčanje je jednako horizontalnoj udaljenosti:

Da se izrazi nagib kao postotni nagib, jednostavno pomnožite dio nagiba sa 100. Dakle, .06 = 6%.

[lateks]displaystyle left( ><>> desno)lijevo( <100>desno)=[/latex]%nagib

U primjeru ceste ispod, promjena visine od šest stopa je uspon, i 100 stopa horizontalna udaljenost puta je trči. Vožnja uzbrdo znači penjanje uz “pozitivnu” padinu od šest posto (slika A). Vozeći nizbrdo, “uspon” je zapravo pad, tako da postoji “negativna,” ili nizbrdo, nagib (slika B). Kada se radi o nagibu, pozitivan nagib jednostavno znači uzbrdo, a negativan nagib znači nizbrdo. Negativan broj ne znači "minus" kao u algebarskim izrazima.

Imajte na umu da je stvarna udaljenost puta hipotenuza ilustrovanog trougla nagiba. Ova dužina se zove rastojanje nagiba. Rastojanje nagiba je uvijek duže od horizontalne udaljenosti ili trčite. Primjenom Pitagorine teoreme (a 2 + b 2 = c 2 ) na ovaj trougao može se izračunati rastojanje nagiba ili hipotenuza (c).

a 2 + b 2 = c 2 gdje je: 100 2 + 6 2 = c 2 10,036 = c 2 [lateks]sqrt<<10,036>>=100.2[/latex]ft.

a = horizontalna udaljenost ili trčanje (u ovom primjeru 100 stopa.)

b= promjena visine ili uspona (u ovom primjeru 6 stopa.)

c = udaljenost puta ili nagib (u ovom primjeru 100,2 ft.)

Rastojanje nagiba je 100,2 stope za stazu od 100 stopa. Kao što možete vidjeti iz ovog primjera, u šumi bi se nagib od šest posto smatrao blagim nagibom.

Imajte na umu da je %nagib bez jedinica i proporcionalan. Stoga se može primijeniti na bilo koju jedinicu mjere (inči, jardi, centimetri, itd.) i na bilo koju dužinu. Na primjer, nagib od 25 posto je jednostavno omjer 25:100. Nagib od 25 posto ispod pokazuje da se nagib raste za 0,25 inča za svaki inč horizontalne udaljenosti. Nagib se podiže za 2,5 centimetra ili svakih 10 centimetara horizontalne udaljenosti, a raste 1,25 inča za svakih 5 inča horizontalne udaljenosti.


Pozadina

Podaci za cijeli genom često imaju oblik niza mjerenja povezanih sa svakim genom u genomu. Ova serija brojeva nazvana je 'genski vektori', a mnoga istraživanja u komparativnoj genomici i sistemskoj biologiji počinju određivanjem udaljenosti, ili sličnosti/različitosti, između svih parova genskih vektora u mjernom prostoru, kako bi se te udaljenosti iskoristile za otkrivanje. odnosa između gena [1]. U kontekstu mjerenja genomske ekspresije, koja je predmet ove studije, jedna od najjednostavnijih i najvažnijih vrsta takvih odnosa može biti koekspresija gena - na primjer, sličan obrazac vrijednosti ekspresije dva gena tokom vremena tijek eksperimenta, ili u različitim tkivima istog organizma, ili sličan obrazac vrijednosti ekspresije dva ortologna gena u homolognim tkivima srodnih organizama [2].

Dostupne su mnoge matematičke formulacije za udaljenosti između dva vektora i zanimljivo je znati kako odabrati odgovarajuću mjeru udaljenosti između mnogih. Veliki dio prethodnog rada na mjerama udaljenosti u računskoj biologiji fokusirao se na svojstva kao što su metrika i aditiv [3, 4], koja imaju blisku vezu s računskom fleksibilnošću algoritama za grupisanje, ali, općenito, nisu dizajnirani da govore bilo šta o biološka vjerodostojnost grupa gena generiranih bilo kojom kombinacijom mjera i algoritma. Ne postoji općenito rješenje za problem odabira optimalne mjere udaljenosti za bilo koju vrstu podataka na skali genoma, a izbor se mora voditi dodatnim informacijama o podacima, npr. poznavanjem modela procesa generiranja podataka ili postojanje referentnog skupa podataka.

Pitanje poređenja profila genske ekspresije postavlja se u funkcionalnom kontekstu (tj., koji geni imaju tendenciju da se reguliraju zajedno?) iu evolucijskom kontekstu. Obrasci ekspresije gena su nasljedne osobine, a predloženo je nekoliko modela evolucije ekspresije [5–7]. Uprkos ovom radu, pa čak i određenom uspjehu u zaključivanju stanja predaka genske ekspresije [8], metode za procjenu evolucijske udaljenosti (divergencije) između gena i vrsta iz njihovih profila genske ekspresije su u povojima. Za procjenu divergencije ekspresije između različitih vrsta korištene su različite mjere, kao što su Euklidska udaljenost, različitost zasnovana na korelaciji i druge udaljenosti (npr. [2, 9–12]), ali se malo znalo o relativnim prednostima svake mjere.

U nedavnoj studiji Pereira i saradnici [13] istraživali su izbor mjere udaljenosti između profila ekspresije gena u različitim tkivima za čovjeka, miša i štakora. U njihovom pristupu, postojala su tri seta profila ekspresije, po jedan za svaku vrstu, a svaki genski vektor imao je osam koordinata (uzoraka tkiva u kojima su mjereni nivoi ekspresije gena). Ortologni odnosi jedan na jedan [14, 15] postoje između velikog dijela gena u tri vrste, tako da se mogu ispitati udaljenosti između parova ortolognih genskih vektora iz svakog od tri moguća para vrsta. Utvrđeno je da udaljenost zasnovana na korelaciji precjenjuje divergenciju ekspresije za gene sa približno ujednačenim obrascima ekspresije između različitih tkiva u tri vrste, vjerovatno zbog nasumične buke koja nije u korelaciji između vrsta. Ovaj efekat nije primećen kod Euklidske udaljenosti. Štaviše, dvije mjere ekspresijske razlike između ortolognih gena u velikoj mjeri nisu bile u korelaciji između svih parova vrsta. Zaključeno je da euklidska udaljenost ima prednost jer ne pojačava šum. Dodatno, navedeno je da je Euklidska udaljenost osjetljivija na apsolutni nivo ekspresije gena od udaljenosti zasnovane na korelaciji.

U ovom radu istražujemo temu optimalnog izbora udaljenosti za analizu profila ekspresije gena i činimo slučaj za blisko podudaranje između matematičkih svojstava mjere udaljenosti i biološkog pitanja. Izbor udaljenosti treba da bude zasnovan na svojstvima i signalima u podacima koji su od interesa za određenu studiju: mjera koja je najprikladnija za otkrivanje i isticanje ovih signala biće optimalna u kontekstu te studije.


Izračunavanje povećanja i veličine

U ovoj aktivnosti učenicima je pokazano kako izračunati uvećanje i veličinu slike koristeći skale. Zatim uče kako izračunati veličinu uzorka pomoću uvećanja. Resursi se mogu projicirati na interaktivnu tablu, a tu je i radni list za učenike sa dodatnim primjerima za vježbanje. Za ovu aktivnost postoji i kratki video screencast.

Opis lekcije

Vodeća pitanja

  • izračunati uvećanje slike elektronskog mikroskopa iz skale?
  • izračunati veličinu uzorka koristeći skalu?
  • izračunati veličinu uzorka pomoću uvećanja?
  • Čulna percepcija. Mikroskopi proširuju ljudski vid, ali možemo li vjerovati u ono što vidimo pomoću mikroskopa?

Aktivnost 1 Izračunavanje uvećanja slike koristeći njenu skalu

Tri slike ispod (kliknite okom da biste otkrili) pokazuju primjer kako izračunati veličinu ćelijskih organela iz elektronskih mikrografija korak po korak. Pažljivo slijedite ove korake, a zatim dovršite proračune na radnom listu.

Smjerna traka je najbolji način da se prikaže veličina originalnog objekta jer bez obzira na povećanje slike, traka mjerila i dalje pokazuje veličinu točno proporcionalno objektu. Koju god veličinu da štampač štampa stranicu, trebalo bi da izračunate istu veličinu.

Postoje tri važne stavke za ovaj proračun, ravnalo, skala i slika.

Nemojte koristiti ravnalo na listu za mjerenje slike, koristite precizno ravnalo označeno u mm.

Ovo je korak po korak objašnjenje izračuna

Kliknite na ikonu oka da biste otkrili još jedan primjer koji možete isprobati.

Aktivnost 2 Izračunavanje veličine uzorka pomoću skale na slici

Ponekad je važna stvarna veličina uzorka. Van Leeuwenhoek je napravio slične proračune za procjenu veličine ćelija u 1600-ima, ali nije imao skalu.

Kliknite na ikonu oka da biste otkrili korak po korak izračunavanje veličine uzorka pomoću skale.

Aktivnost 3 Izračunavanje veličine uzorka pomoću uvećanja slike

Ponekad nema skale, ali je dato uvećanje slike.
Slika ispod prikazuje tri koraka za izračunavanje veličine slike pomoću uvećanja.

Učenici mogu ispuniti dva primjera svakog proračuna na radnom listu Izračunavanje uvećanja i veličine

Aktivnost 4 - Nesigurnosti u ovim mjerenjima sa lenjirima

Ako biste izmjerili ovu skalu, da li biste je izmjerili kao 52 ili 53 mm?

Kod IB striktno dužina dužina treba biti zabilježena kao 52 mm +/- 1 mm.

+/- 1 mm se naziva nesigurnost. To znači da stvarna dužina može biti 51, 52 ili 53 mm.

Zašto je ovo? Kliknite na ikonu da vidite objašnjenje.

Prvo dolazi do neizbježne greške kada se nula ravnala poravna.

Postoji i greška kada pročitate kraj reda. Ovo je takođe 0,5 mm.

Ako zbrojite ove dvije vrijednosti zajedno, dobije se očitavanje s nesigurnošću od +/- 1 mm.

Općenito načelo je da je lenjir precizan samo na +/- najmanju podjelu na ravnalu.

Dodatne informacije o nesigurnostima u biologiji

Postoji još jedna prilika da se istraže ove ideje nesigurnosti u eksperimentu s biološkom mjernom opremom.

Bilješke nastavnika

Ova lekcija je dobar uvod u mjerenje veličine ćelija pomoću skale.

Pri prelasku odgovora učenici će ponekad imati malo drugačije odgovore zbog malih mjernih razlika. Ovo može navesti učenike da pitaju, "koji je pravi odgovor"? Ovo je odlična prilika da objasnite greške i nesigurnosti mjerenja.

Odličan završetak ove lekcije bio bi da se utvrdi koje su nesigurnosti u mjerenjima, koliko su tačne veličine koje su upravo izračunate. Ovo je cilj aktivnosti 4.

Postoji i nekoliko dodatnih resursa:

Lista vokabulara – korisno je uvesti ove pojmove prije početka mjerenja

Alternativni radni list 1

Alternativni radni list 2

Ovaj radni list je alternativa gornjoj aktivnosti. Ima manje smjernica za studente pa može odgovarati pametnijim studentima. Koristite slike elektronskog mikroskopa da odredite stvarnu veličinu i/ili uvećanje slike.

postoje neki modeli odgovora za ovaj radni list ovdje: Alternativni radni list 2 modela odgovora


Kako koncentracija gela utječe na relativnu pokretljivost

Dakle, šta se događa ako želite okarakterizirati sve proteine ​​u uzorku? . pokrenite više od jednog gela, naravno! Gel male gustoće će razlučiti veće polipeptide dok će odsjeći lakše, a jedan veće gustine će otkriti manje polipeptide, dok će komprimirati i eventualno izobličiti veće.

Evo nekoliko primjera učinka koncentracije akrilamida na relativnu pokretljivost. Standardi molekularne težine su identifikovani brojem. Prikazan je i tipičan uzorak proteina membrane eritrocita, sa proteinom trake 3 označenim kao referenca.

Standard 1 = miozin (205,000) std. 2 = beta-galaktozidaza (116.000) std. 3 = fosforilaza B (92,000) std. 4 = goveđi serum albumin (66.000) std. 5 = albumin jaja (45.000) std. 6 = karboanhidraza (29.000).

Na gelovima od 6 do 10% postoji izrazit tamni dublet na vrhu membranske trake. Primijetite da je u 12% gelu dublet spojen i izgleda kao jedna traka. Moglo bi se procijeniti MW opsega 3 iz prvih pet gelova, iako najbolja procjena dolazi od 6%, koji je proizveo najveće razdvajanje između standarda s obje strane pojasa 3. Gel od 12% nije razriješio trake uopće dobro iznad četvrti standard (serumski albumin, 66.000). Analiza bi trebala biti ograničena na dio gela ispod 66.000 ili čak niže ako je isti uzorak rađen na gelu niže gustine.

Studenti često analiziraju gornji dio akrilamidnog gela visoke gustine koji se preklapa sa dijelom gela niže gustine. Ta praksa sugerira da je student promašio poentu analize i/ili da nije razumio ograničenja metode. Tumačite samo onaj dio gušćeg gela koji se ne preklapa s drugim. Drugim riječima, koristite gelove visoke gustoće za proučavanje proteina (ili dijelova proteina) relativno male molekularne težine, a gelove niže gustine za razrjeđivanje proteina veće molekularne težine.

Ne zaboravite da različiti polipeptidi mogu imati slične ili čak identične molekularne mase. Jedna traka na gelu se stoga može sastojati od jednog ili više polipeptida. To će se najvjerovatnije dogoditi prema vrhu gela, a posebno u gelovima veće gustine.


Nautička karta

Kao navigator, nautička karta je jedan od vaših najvažnijih alata. Dijagram je grafički prikaz dijela zemljine površine. Za razliku od karte, grafikon naglašava vodena područja i karakteristike koje omogućavaju pomorcima da odrede položaj, izbjegnu opasnosti i pronađu siguran put do odredišta.

Karte pokrivaju otvoreno more, obale, plovne kopnene vode i sisteme kanala. Oni mogu pokriti veliko područje, na primjer, brodske puteve sjevernog Atlantika ili pružiti detaljan prikaz manjeg područja, kao što je luka ili sidrište.

Većina pomorskih zemalja objavljuje karte i Kanada nije izuzetak. Kanadske papirne i elektronske karte objavljuje Kanadska hidrografska služba (CHS). Ove karte su dostupne u trgovinama i prodavačima karata. Sjedinjene Države i Velika Britanija objavljuju karte za svoje vode i veliki dio plovnih voda na Zemlji.

Projekcije

Izazov je za kreatore grafikona da prenesu karakteristike sferne zemlje na ravan komad papira. Rješenje leži u korištenju matematičkih formula za kreiranje projekcija. Različite formule daju različite projekcije i postoji mnogo tipova, od kojih svaka ima svoje posebne karakteristike. Nautičke karte su obično jedna od tri: Gnomonic (izgovara se no-monic), Polikonik i Mercator. Mercatorova projekcija je najčešća.

U Mercatorovoj projekciji meridijani geografske dužine su paralelni. Linije geografske širine, iako su i dalje paralelne, više nisu jednako udaljene, već šire udaljene dalje na sjever. Ovo uzrokuje izobličenje oblika i veličine kopnenih i okeanskih masa jer se ove karakteristike povećavaju bliže polovima.

Prednost Mercatorovog grafikona je u tome što se meridijani i paralele ukrštaju pod pravim uglom i formiraju pravougaonu mrežu. To znači da se pravolinijski tok kroz vodu može nacrtati kao prava linija na grafikonu — nešto što nije moguće na drugim projekcijama.

Pregled grafikona

Karta identificira plovne oblasti, obale i područja koja nisu pogodna za plovidbu. Ukazuje na dubinu vode, ili sondiranje lokacije kamenja i drugih opasnosti, područja sušenja plima kao i duboke vode. Grafikon također ukazuje na lokaciju i vrstu navigacijskih pomagala, te prikazuje simbole za stupove, mostove i druge građevine. Znamenitosti na obali koje mogu pomoći u navigaciji, kao što su radio tornjevi i crkveni tornjevi, također su simbolizirani.

Grafikoni različitih agencija (tri agencije prave grafikone u SAD) i zemlje mogu izgledati drugačije, ali postoji mnogo zajedničkih karakteristika.

Kanadski i američki grafikoni su slični i nije teško razumjeti jedan ako ste upoznati s drugim. Treba obratiti pažnju na bilo kakvu razliku u skali, mjernim jedinicama, datumu objavljivanja i tako dalje.

Tabela se obično štampa na izdržljivom papiru kako bi bila vodootporna. Numeriran je za referencu na katalog, ima naslove glavnih i sporednih područja pokrivenosti i navodi datum njegovog objavljivanja.

Mreža geografske širine i dužine je prekrivena na svim kartama. U većini nautičkih projekcija, paralele su graduirane duž bočnih strana karte. Geografska dužina je stepenovana duž vrha i dna grafikona. Podjele ovih skala su u stepenima, minutama, pola minuta i desetinkama minuta ili sekundama u starijim grafikonima.

Skala geografske širine i dužine pojavljuje se na rubovima većine tipova nautičkih karata.

Naslovni blok

Jedna istaknuta karakteristika grafikona je naslovni blok. Sadrži informacije o području pokrivenosti, skali karte, vrsti projekcije, referentnom nivou za sondiranje i jedinicama mjerenja dubine i nadmorske visine: metričke ili imperijalne. Takođe navodi sve napomene upozorenja.

Datum i zvukovi

Podatak karte se definiše kao nivo ispod kojeg voda rijetko pada. Sondiranja se odnose na dubine u datumu.

Scale

Dijagram može pokriti veliko područje — cijelo jezero Huron, na primjer — ili detaljan prikaz manjeg područja. Razlika u području pokrivenosti odnosi se na skalu grafikona.

Skala grafikona je omjer udaljenosti na karti i udaljenosti na kopnu ili vodi. Razmjera 1:8 000 znači da je grafikon jedan osamhiljaditi dio površine koju predstavlja: Objekti prikazani kao jedan centimetar međusobno su fizički udaljeni 8000 centimetara (80 metara).

Obalna karta obično ima razmjer između 1:50 000 i 1:150 000. Razmjer lučke karte je obično 1:10 000.

Grafikon koji daje mnogo detalja za malo područje je grafikon velikog razmjera. Grafikon koji pokriva veliko područje i pruža malo detalja je dijagram male razmjere. Zapamtite:

Ista geografska oblast može biti pokrivena nekoliko grafikona sa različitim skalama.

Simboli

Grafikoni koriste simbole za predstavljanje objekata iz stvarnog svijeta. Poznavanje ovih simbola, kao i njihovih uobičajenih skraćenica i terminologije, važan je dio korištenja grafikona. Simboli su obrađeni u lekciji 2.2.

Measuring Distance

Budući da je grafikon skalirani prikaz stvarnog svijeta, može se koristiti za mjerenje udaljenosti između objekata. Ovo je korisno, između ostalog, za procjenu vremena plovidbe ili vožnje automobilom između tačaka.

Na Mercator grafikonu, skala geografske širine sa strane karte služi kao skala udaljenosti.

Vrijedi zapamtiti da se za mjerenje udaljenosti može koristiti samo vertikalna skala geografske širine na Mercatorovu grafikonu, a ne horizontalna skala geografske dužine. To je zato što je svaki minut geografske širine jednak jednoj nautičkoj milji, dok se udaljenost između minuta geografske dužine smanjuje između ekvatora i polova.

Razdjelnici se koriste za prijenos udaljenosti između dva ucrtana objekta na skalu geografske širine na bočnoj strani karte ili sa skale geografske širine na bilo koju tačku na karti.

Naslov CHS grafikona.
Razmjera ove obalne karte je 1:50 000.
Skala geografske širine je skala udaljenosti na Mercator karti jer je jedan minut geografske širine jednak jednoj nautičkoj milji.

Pronalaženje koordinata

Razdjelnici se također koriste za prenošenje koordinata geografske širine i dužine pozicije na grafikon ili za pronalaženje koordinata pozicije. Grafikoni imaju mrežu referentnih linija koje omogućavaju precizno prenošenje koordinata.

Geografska širina svjetla u Cabot Headu se nalazi postavljanjem jedne tačke razdjelnika na simbol grafikona svjetla, a druge na najbližu referentnu liniju geografske širine.

Razdjelnici se zatim prenose na stranu karte i geografsku širinu zabilježe sa skale.

Za pronalaženje geografske dužine proces se ponavlja pomoću vertikalne referentne linije i skale na dnu ili na vrhu grafikona.

Grafikoni i promjene

Karte brzo zastarevaju: bove se pomeraju, uklanjaju ili menjaju, obala se pomera ili se pojavljuju nove opasnosti. Lekcija 1.4 ispituje kako Obavijesti za pomorce obavještavaju nautičare o promjenama karata između publikacija. U Kanadi CHS grafikoni su revidirani kako bi uključili promjene napravljene između publikacija. Godina ovih revizija je odštampana u donjem levom uglu grafikona.


Metrički sistem

Metrički sistem je međunarodno prihvaćen mjerni sistem koji je, sa izuzetkom Sjedinjenih Država, jedini sistem mjerenja koji se koristi.

Ovaj sistem mjerenja se koristi za težinu i masu, udaljenost i vrijeme. Metrički sistem je zasnovan na mjernim jedinicama odobrenim i podržanim od strane Međunarodnog sistema jedinica, koji se naziva SI jedinice.

Kao što ćete vidjeti u nastavku, metrički sistem je izgrađen na 10-kama i višekratnicima, ili stepenima, desetica. Više informacija o metričkom sistemu i drugim sistemima mjerenja prethodno je bilo detaljno u odeljku Matematika ovog pregleda TEAS-a pod naslovom "Mjerenje i podaci".

Osnovne jedinice za težinu i masu, zapreminu, udaljenost i vrijeme su kilogram, litar za mjerenje tekućine, metar i sekunda.

Kao što je prethodno diskutovano:

  • Masa je fizičko svojstvo tvari koje predstavlja otpor objekta na kretanje kada se primjenjuje sila i izražava se u kilogramima (kg)
  • Volumen je fizičko svojstvo tvari koje predstavlja mjerenje količine ili količine materije u trodimenzionalnom prostoru
  • Težina je sila objekta protiv gravitacije
  • Udaljenost je dužina jednog kraja do drugog
  • Vrijeme je trajanje stvari i događaja tokom prošlosti, sadašnjosti i budućnosti.

Mjerenjima manjim i više od jedne mjerne jedinice za težinu i masu, zapreminu, udaljenost i vrijeme prethodi prefiks kao što je:

  • Centi što znači 1/100 ili 1 stoti dio
  • Deca što znači 10
  • Hecta što znači 100 ili 100
  • Kilo što znači 1 hiljada ili 1000
  • Mlli što znači 1 milion ili 1.000.000

Na primjer, kilometar je 1.000 metara, a 1 metar je 1.000 milimetara.

Mjerenja dužine koja su varijacije metra s prefiksom uključuju:

  • 1 centimetar = 10 milimetara
  • 1 decimetar = 10 centimetara ili 100 milimetara
  • 1.000 milimetara (1 metar) = 100 centimetara
  • 1 kilometar = 1.000 metara

6. Kaliper

Digital Caliper

U slučaju da ćete sa velikom preciznošću i preciznošću posmatrati prečnik malog objekta, potreban vam je ovaj alat. Kaliper može mjeriti s rezolucijom do 0,01 milimetara. Pomoću ovog mjernog instrumenta možete vršiti vanjska i unutarnja mjerenja, pa čak i dubinu.

Ako ćete mjeriti vanjski prečnik cijevi, koristite vanjsko mjerenje (veće čeljusti). Dok, ako ćete mjeriti unutrašnji prečnik, koristite manje čeljusti i ove stvari mogu raditi očekivano. Međutim, to je tri u jednom gdje također možete izmjeriti dubinu te cijevi. Potpuno je kompletan.

Postoje tri tipa čeljusti: čeljusti s noniusom, čeljusti za brojčanike i digitalne čeljusti. Možete odabrati koji je pogodan za vaše potrebe mjerenja.


Measuring Plant Growth

Da biste prikupili dovoljno podataka o ukupnom zdravlju vaših biljaka, preporučujemo da zabilježite barem jednu konačnu mjeru težine, jednu mjeru zdravlja korijena i sva mjerenja promatranja koja se odnose na vrstu biljke koju koristite.

Vaganje biljaka: svježe naspram suhe težine

  • Mjerenje svježe težine: Dok tehnički možete izmjeriti svježu težinu biljaka, a da im ne oštetite, jednostavan čin uklanjanja biljke iz njenog rastućeg "medija" može uzrokovati traumu i utjecati na tekuću stopu rasta, a time i na vaš eksperiment. Mjerenje svježe težine biljaka je teško i vjerovatno bi ga trebalo sačuvati kao konačnu mjeru rasta na kraju eksperimenta. Evo postupka za mjerenje svježe težine:
    1. Uklonite biljke iz zemlje i isperite sve rastresito tlo.
    2. Biljke nježno obrišite mekim papirnim ubrusom kako biste uklonili vlagu sa slobodne površine.
    3. Izvagajte odmah (biljke imaju visok sastav vode, pa čekanje na njihovo vaganje može dovesti do određenog sušenja i stoga proizvesti netačne podatke).
  • Mjerenje suhe težine: Budući da biljke imaju visok sastav vode i da će nivo vode u biljci ovisiti o količini vode u njenoj okolini (koju je vrlo teško kontrolisati), korištenje suve težine kao mjere rasta biljaka ima tendenciju budite pouzdaniji. Ove podatke možete uhvatiti samo jednom kao konačnu mjeru na kraju eksperimenta.
    1. Uklonite biljke iz zemlje i isperite sve rastresito tlo.
    2. Ubrišite biljke uklanjajući svu slobodnu površinsku vlagu.
    3. Osušite biljke u pećnici postavljenoj na nisku vatru (100° F) preko noći.
    4. Ostavite biljke da se ohlade u suvom okruženju (ziploc vrećica će zadržati vlagu) - u vlažnom okruženju biljno tkivo će uzeti vodu. Nakon što se biljke ohlade izmjerite ih na vagi.
    5. Biljke uglavnom sadrže vodu, pa se pobrinite da imate vagu koja se spušta na miligrame jer suha biljka neće imati veliku težinu.

Root Mass

Masa korijena se preporučuje kao konačno mjerenje jer se biljka mora ukloniti iz podloge za uzgoj kako bi se dobili precizni podaci. Postoji dosta različitih metoda za mjerenje mase korijena ovisno o vrsti i strukturi korijena

  • Tehnika ukrštanja mreže:
    1. Uklonite biljku iz zemlje.
    2. Ako radite s tankim ili svijetlim korijenjem, možda ćete htjeti obojiti korijenje kiselom bojom.
    3. Položite korijenje na mrežu i izbrojite koliko puta korijeni sijeku mrežu.
  • Ocrtajte korijene na papiru, izmjerite svaki od tragova i izračunajte dužinu korijena na osnovu tragova.
  • Izbrojite broj korijena.
  • Izmjerite prečnik korijena. Ovo je posebno korisno za korjenasto povrće kao što su cvekla, šargarepa, krompir itd. koje ima veliki koren.

Root Shoot Ratio

Korijeni omogućavaju biljci da apsorbira vodu i hranjive tvari iz okolnog tla, a zdrav korijenski sistem je ključ zdrave biljke. Omjer korijena i izdanaka je jedna mjera koja vam pomaže u procjeni ukupnog zdravlja vaših biljaka. Vaša kontrolna grupa biljaka pružit će vam "normalan" omjer korijen:izdanak za svaku od vaših vrsta biljaka, sve promjene u odnosu na ovaj normalan nivo (bilo gore ili dolje) bi bile pokazatelj promjene u ukupnom zdravlju vaše biljke . Važno je kombinovati podatke iz omjera korijen:izdanak s podacima iz zapažanja kako biste dobili točno razumijevanje onoga što se događa s vašim biljkama. Na primjer, povećanje omjera korijen:izdanak može biti pokazatelj zdravije biljke, pod uvjetom da je povećanje došlo zbog veće veličine korijena, a NE zbog smanjenja težine izdanaka. Za mjerenje omjera korijen:izdanak:

  1. Uklonite biljke iz zemlje i isperite sve rastresito tlo.
  2. Ubrišite biljke uklanjajući svu slobodnu površinsku vlagu.
  3. Osušite biljke u pećnici postavljenoj na nisku vatru (100° F) preko noći.
  4. Ostavite biljke da se ohlade u suvom okruženju (ziploc vrećica će zadržati vlagu) - u vlažnom okruženju tkivo će upijati vodu. Nakon što se biljke ohlade izmjerite ih na vagi.
  5. Odvojite korijen od vrha (presječite na liniji tla).
  6. Odvojeno izmjerite i zabilježite korijen i vrh za svaku biljku. (Suha težina korijena/suha težina vrha biljke = omjer korijen/izdanak)
  7. Omjer korijen/izdanak može se izračunati za svaki tretman.
  8. Biljke uglavnom sadrže vodu, pa se pobrinite da imate vagu koja se spušta na miligrame jer suha biljka neće imati veliku težinu.

Opservacija

Postoji mnogo različitih karakteristika biljke koje se mogu izmjeriti posmatranjem kako bi se odredio stepen rasta/zdravlja biljke. Sljedeća tabela opisuje neke od mjera koje možete poduzeti i također preporučuje koliko često biste trebali vršiti ova zapažanja tokom eksperimenta.


Elektronski dodatni materijal

13059_2014_3263_MOESM1_ESM.pdf

Dodatni fajl 1: Vezano za sliku 1: Šematski prikaz bioloških uzoraka za 4sUDRB-seq. HeLa ćelije ili nisu tretirane (NT) ili su tretirane sa DRB tokom 3 sata i sakupljene 4 ili 8 minuta nakon uklanjanja DRB. U oba slučaja, ćelije su pulsirane sa 4sU poslednjih 8 minuta pre nego što su sakupljene. (PDF 274 KB)

13059_2014_3263_MOESM2_ESM.pdf

Dodatni fajl 2: U vezi sa slikom 2: Korelacija između bioloških ponavljanja. Pirsonova korelacija između prosječnih signala nad intronima za sve gene duže od 10Kb. Specifičan tretman (NT, 0 min, 4 min, 8 min) i broj uzorka (1,2,3,4) su naznačeni za svaki ponovljeni uzorak. (PDF 141 KB)

13059_2014_3263_MOESM3_ESM.pdf

Dodatni fajl 3: U vezi sa slikom 3: Distribucija intervala pouzdanosti. Distribucija intervala povjerenja za sve gene za koje su našim algoritmom uspješno otkrivene granice elongacije u uzorcima od 4 i 8 minuta. Geni ostavljeni do crvene tačkaste linije uzeti su za dalju analizu kako je opisano u tekstu. (PDF 92 KB)

13059_2014_3263_MOESM4_ESM.xlsx

Dodatni fajl 4: U vezi sa slikom 4: Lista stopa elongacije i njihovih intervala pouzdanosti. Uključeni su samo geni sa intervalom pouzdanosti boljim od ±0,5 Kb. (XLSX 131 KB)

Vezano za sliku 5: Validacija stopa elongacije transkripcije.

Dodatni fajl 5: (A, B) qRT-PCR analiza RBM33 i CLCN3 pre-mRNA u HeLa ćelijama, bez DRB tretmana (NT) iu naznačenim vremenskim tačkama nakon uklanjanja DRB. Da bi se simulirali eksperimentalni uslovi DRB-seq eksperimenta, 4sU je dodan svim kulturama 8 minuta prije žetve, iako naknadna biotinilacija i pročišćavanje nisu izvršeni jer korištenje introničkih prajmera u qRT-PCR proceduri već odabire pre-mRNA. Sve vrijednosti su normalizirane na 18S RNK u istom uzorku. Trake označavaju prosječne vrijednosti podataka iz duplih qPCR reakcija. Trake greške predstavljaju standardnu ​​devijaciju. (A) i (B) izvedeni su iz dva nezavisna eksperimenta, koristeći različite qPCR parove prajmera. (PDF 364 KB)

13059_2014_3263_MOESM6_ESM.xlsx

Dodatni fajl 6: U vezi sa slikom 6: Lista relativnih frekvencija inicijacije transkripcije. Relativna inicijaciona frekvencija izračunata je usrednjavanjem vrednosti nagiba četiri biološka ponavljanja 8-minutnih uzoraka. Izuzetnici su isključeni. (XLSX 116 KB)

13059_2014_3263_MOESM7_ESM.pdf

Dodatni fajl 7: Vezano za sliku 7: Korelacija relativnih inicijacijskih frekvencija izračunatih sa ili bez uključivanja prvih 2Kb gena. Dijagram rasipanja relativnih inicijacijskih frekvencija izračunatih za pune transkripte (x-osa) u odnosu na relativne inicijalne frekvencije izračunate nakon isključivanja prvih 2 Kb svakog transkripta (y-osa). (PDF 198 KB)


Pogledajte video: Prezentacija biologija (Decembar 2022).