Informacije

12.15: Evolucija vodozemaca i ekologija - Biologija

12.15: Evolucija vodozemaca i ekologija - Biologija


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Zašto su vodozemci bili tako uspješni?

Možda nisu imali mnogo predatora na kopnu prije 365 miliona godina. S obzirom na obilje zemlje i hrane, imali su resurse da napreduju. Ovo je fosil žabe iz eocenske epohe. Kičmeni stub i četiri uda se lako mogu prepoznati.

Evolucija vodozemaca

Fosilni dokazi pokazuju da su vodozemci evoluirali prije oko 365 miliona godina od pretka plućne ribe s režnjevima. Kao najraniji kopneni kralježnjaci, bili su vrlo uspješni. Neki od njih su bili mnogo veći od današnjih vodozemaca. Više od 100 miliona godina, vodozemci su ostali dominantni kopneni kičmenjaci. Zatim su neki od njih evoluirali u reptile. Kada su se pojavili gmizavci, sa svojim amnionskim jajima, zamijenili su vodozemce kao dominantne kopnene kičmenjake.

Ekologija vodozemaca

Vodozemci se mogu naći u slatkovodnim i vlažnim kopnenim staništima širom svijeta. Jedini kontinent bez vodozemaca je Antarktik. Vodozemci su posebno brojni u umjerenim jezerima i barama te u tropskim prašumama.

Vodozemci kao plijen i grabežljivci

Vodozemci su važan izvor hrane za životinje kao što su ptice, zmije, rakuni i ribe. Vodozemci su takođe važni grabežljivci. Kao ličinke, hrane se uglavnom malim vodenim životinjama kao što su vodeni insekti. Mogu se hraniti i algama. Kao odrasli, vodozemci su potpuno mesojedi. Mogu hvatati i jesti crve, puževe i insekte, poput žabeSlika ispod se radi. Za razliku od drugih vodozemaca, cecilije jesu burrowers. Koriste svoju glavu da kopaju u tlu, a hrane se glistama i drugim anelidama. Cecilije se mogu naći u vlažnom tlu u blizini rijeka i potoka u tropskim regijama.

Žaba Predator. Žaba jede svoj plijen insekata.

Prijetnja izumiranja vodozemaca

Trenutno se gotovo jedna trećina svih vrsta vodozemaca suočava s prijetnjom izumiranja. Razlozi uključuju gubitak staništa, zagađenje, klimatske promjene i unošenje alohtonih vrsta. Većina ovih problema rezultat je ljudskih radnji.

Vodozemci imaju propusnu kožu koja lako upija tvari iz okoline. Ovo može objasniti zašto se čini da su posebno osjetljivi na zagađenje. Praćenje zdravlja i preživljavanja vodozemaca može pomoći ljudima da rano otkriju zagađenje, prije nego što drugi organizmi budu pogođeni.

Sažetak

  • Vodozemci su evoluirali prije oko 365 miliona godina od pretka ribe s režnjevim perajima.
  • Kao najraniji kopneni kičmenjaci, vodozemci su bili vrlo uspješni više od 100 miliona godina sve dok reptili nisu preuzeli vlast kao dominantni kopneni kičmenjaci.
  • Vodozemci se nalaze u cijelom svijetu osim na Antarktiku i Grenlandu.
  • Vodozemci su važan plijen za životinje kao što su ptice, zmije i rakuni. Oni su važni grabežljivci insekata, crva i drugih beskičmenjaka.
  • Do jedne trećine svih vrsta vodozemaca je u opasnosti od izumiranja zbog ljudskih aktivnosti, kao što su uništavanje staništa, klimatske promjene i zagađenje.

Pregled

  1. Objasnite zašto su vodozemci mogli postati dominantni kopneni kičmenjaci milionima godina.
  2. Šta je bio predak vodozemaca?
  3. Zašto su vodozemci zamijenjeni gmizavcima kao dominantnim kopnenim kičmenjacima?

Dvesta miliona godina evolucije veličine tela anura u odnosu na geografiju, ekologiju i istoriju života

Molly C. Womack, Odsjek za zoologiju kralježnjaka, Nacionalni muzej prirodne historije, Smithsonian Institution, 1000 Constitution Ave NW, Washington, DC 20560.

Odjel za zoologiju kralježnjaka, Nacionalni muzej prirodne historije, Smithsonian Institution, Washington, District of Columbia, SAD

Odeljenje za herpetologiju, Kalifornijska akademija nauka, San Francisko, Kalifornija, SAD

Odjel za zoologiju kralježnjaka, Nacionalni muzej prirodne historije, Smithsonian Institution, Washington, District of Columbia, SAD

Odsjek za biologiju, Državni univerzitet Utah, Logan, Utah, SAD

Molly C. Womack, Odsjek za zoologiju kralježnjaka, Nacionalni muzej prirodne historije, Smithsonian Institution, 1000 Constitution Ave NW, Washington, DC 20560.

Odjel za zoologiju kralježnjaka, Nacionalni muzej prirodne historije, Smithsonian Institution, Washington, District of Columbia, SAD

Odeljenje za herpetologiju, Kalifornijska akademija nauka, San Francisko, Kalifornija, SAD

Abstract

Iznenađujuće, malo se zna o evoluciji veličine tijela unutar najraznovrsnijeg reda vodozemaca, anurana (žaba i krastača), uprkos poznatim učincima veličine tijela na fiziološke, ekološke i životne karakteristike životinja općenito. Ovdje smo ispitali evoluciju veličine tijela anura među 2434 vrste sa preko 200 miliona godina zajedničke evolucijske istorije. Pronašli smo evolucijske pomake specifične za klade prema novim optimalima veličine tijela zajedno s brojnim neovisnim prijelazima na gigantske i minijaturne veličine tijela, unatoč tome što su gornje granice veličine tijela anura ostale prilično konzistentne kroz fosilni zapis. Pronašli smo slabu, pozitivnu korelaciju između veličine tijela vrste i maksimalne geografske širine i nadmorske visine, uključujući nedostatak malih vrsta na višim nadmorskim visinama i širim rasponima širine i elevacije kod većih anurana. Iako smo otkrili skromne razlike u srednjoj veličini tijela anura među mikrostaništima, došlo je do velikog preklapanja u rasponu veličina tijela u mikrostaništima. Konačno, otkrili smo da je veća vjerovatnoća da će veći anurani konzumirati plijen kralježnjaka nego manji anurani i da su vrste sa fazom larve koje slobodno pliva tokom razvoja u prosjeku veće od onih kod kojih se razvoj u žabu odvija unutar jajeta. Sve u svemu, veličina tijela anurana nije u skladu s geografskim i ekološkim obrascima uočenim kod drugih tetrapoda, ali je možda značajnija po varijacijama u veličini tijela unutar geografskih regija, ekologije i životne istorije. Ovdje dokumentiramo ovu varijaciju i predlažemo ciljne klade za detaljne studije koje imaju za cilj da otkriju kako i zašto su varijacije u veličini tijela nastale i održavane u anuranima.


Pregled za 2020

Prošla godina nas je sve upoznala s novim nizom izazova koji su mnogima donijeli teškoće i tragediju. Međutim, uprkos ovim poteškoćama, dobre vijesti su postojale tokom 2020. godine, a ovdje ću iznijeti neke od razloga za slavlje koji su se desili za studente E2G2 diplomaca!

  • Tri nova diplomirana studenta su doktorirala kod nas! Maria Castaño, Matthew Lindsay i Xiaomi Liu!
  • Rose Driscoll, doktorandica u laboratoriji Brisson, dobila je GRFP, prepoznajući njene velike vještine kao istraživača i obećavajući doprinos nauci!
  • Emery Logan dobio je nagradu Edward Peak Curtis za izvrsnost u podučavanju kao diplomirani student!
  • Univerzitet u Rochesteru bio je domaćin drugog godišnjeg sastanka evolucione genomike Velikih jezera! Uprkos potrebi da se pređe na onlajn platformu, sastanak ima ogroman uspeh sa mnogim fascinantnim izlagačima!
  • Četiri doktoranta položila su kvalifikacione ispite: Rose Driscoll, Lauren Gregory, Jeremy Summers i Nilima Walunjkar!

2021. će sigurno ponuditi svoj niz izazova, ali se nadamo da će članovi naše zajednice nastaviti raditi velike stvari!


Nedavne publikacije

Barrow LN, McNew SM, Mitchell N, Galen SC, Lutz HL, Skeen H, Valqui T, Weckstein JD, Witt CC. 2019. Duboko očuvana osjetljivost u sistemu sa više domaćina i parazita. Ecology Letters 22:987&ndash998.

Ovaj projekt je rezultat opsežne suradnje između istraživača iz Muzeja jugozapadne biologije, Field Museuma i el Centro de Ornitología y Biodiversidad. Analizirali smo raznoliku grupu domaćin-parazit uzorkovanu duž elevacijskih gradijenta u Peruu (skoro 4000 ptica iz 523 vrste domaćina!) i pokazali da je osjetljivost na parazite malarije kod ptica duboko očuvana u filogeniji ptica. Filogenija domaćina bila je važna čak i nakon što se uzme u obzir širok skup okolišnih, vremenskih i životnih prediktora zaraze, što sugerira da su varijacije u osjetljivosti među domaćinima povezane s evolucijski očuvanim aspektima odbrane ptičijeg domaćina.

Barrow LN, Allen JM, Huang X, Bensch S, Witt CC. 2019. Zahvaćanje genomske sekvence hemosporidijskih parazita: Metode i izgledi za poboljšano proučavanje evolucije domaćin-parazit. Molecular Ecology Resources 19:400&ndash410.

Kao NSF postdoc (Program istraživanja pomoću bioloških kolekcija), razvio sam metode za "hvatanje" podataka o genomu parazita iz uzoraka tkiva ptica. Ova tehnika omogućava sekvencioniranje stotina genetskih markera parazita kod ptica s relativno niskim intenzitetom parazita (% inficiranih krvnih stanica, ili parazitemija). Ovi rezultati su uzbudljivi jer su infekcije niskog nivoa česte u populacijama divljih ptica, što je činilo izazovnim dobivanje genomskih sekvenci od ovih parazita. Ovi podaci na razini genoma pomažu u rješavanju filogenetskih odnosa parazita i mogu poboljšati naše razumijevanje specijacije parazita, biogeografije i asocijacija domaćina.


David Grey - bihevioralna ekologija, seksualna selekcija, specijacija

Profesor i specijalni asistent dekana
dr.sc. Univerzitet u Novom Meksiku
email: [email protected]
Telefon: (818) 677-7653
Fax: (818) 677-2034
Ured: Chaparral Hall 5327
Website

Proučavam evoluciju ponašanja insekata, uglavnom seksualnu signalizaciju i njene posljedice kod cvrčaka. Ovo nužno integrira polja ponašanja životinja, bihejvioralne i evolucijske genetike i evolucijske ekologije. Moj rad pokušava da se pozabavi i mikroevolucionim i makroevolucionim uzrocima i posledicama izbora partnera. Ovo istraživanje ima i terensku i laboratorijsku komponentu i koristi širok spektar tehnika od molekularne i kvantitativne genetike do bioakustičkih i bihevioralnih pristupa.


Uzgon, gravitacija i kretanje na kopnu

Voda je 800 puta gušća i 60 puta viskoznija od vazduha (Dejours, 1976, 1988, tabela 1). Stoga se vodene životinje moraju nositi s većim otporom trenja (zbog viskoznosti) i potrošiti više rada na borbu protiv inercije (zbog gustine) u odnosu na kopnene životinje. Ovi fizički faktori imaju energetske i mehaničke posljedice za kretanje, što općenito zahtijeva više napora u vodi nego u zraku (Graham, 2006), utičući na aktivnosti uključujući hranjenje, kretanje i disanje. U vodi, neke ribe mogu postići neutralnu plovnost koristeći plivaći mjehur napunjen plinom tako što lebde, minimiziraju potrošnju energije u mirovanju (McNeill Alexander, 1993.) (iako mnogim malim, morskim amfibijskim ribama nedostaju plivaći mjehur Martin, 2015.). Jednom kada riba izroni, nedostatak uzgona i povećanje prividne gravitacije će stisnuti tkiva. Dakle, kopnene i vodozemne životinje imaju tendenciju da imaju robusniji mišićno-koštani sistem (Ashley-Ross et al., 2013).

Svojstva vode i vazduha i fiziološke posledice

odgB7MLeBKnVNzLTROCtWZAKqL2QTVRdVnGL69zqtKXcj1ZBTN3Sjd12-o6RbImbATcWlHuR-C1QG6tOdGTCln1j-DLYK13Xu0z0IGf3X9jPPJVKwG6k0zKCgMtKMu6t3fLmVMQ __ & ampKey-Pair-Id = APKAIE5G5CRDK6RD3PGA "/>

Vodozemne ribe usvojile su raznoliku lepezu kopnenih strategija kretanja unatoč nedostatku dodataka i općenito imaju oblike tijela mnogo prikladnije za plivanje (npr. Harris, 1960 Ellerby et al., 2001 Swanson i Gibb, 2004 Sayer, 2005 Gibb et al., 2011 -Ross i sur., 2013. Pronko i sur., 2013. Close i sur., 2014. Pace i Gibb, 2014. Standen i sur., 2014. Bressman i sur., 2015. Flammang et al., 2016.). Jedna strategija je oslanjanje na fiksne adaptacije koje predstavljaju kompromis za kretanje u zraku i vodi. Ovo se vidi kod muljastih skipera, koji prave kratke, ali česte jurišove na kopno (Harris, 1960). Druga strategija je da se izrazi plastično lokomotorno ponašanje i morfologija. Ako amfibijske ribe izlaze danima ili sedmicama, da li mišićno-koštani sistem postaje jači kao odgovor na povećanu prividnu gravitaciju? Da li kopnena vježba kod riba (npr. skiperi na traci za trčanje Jew et al., 2013.) dovodi do istog efekta treninga kao što je uočeno kod plivanja (McClelland, 2012.)? Trebaju li ribe uravnotežiti kompromise prilikom prilagođavanja lokomotornih performansi za vodenu u odnosu na kopnenu lokomociju i, ako da, kako vremena kašnjenja u indukciji i preokretu ovih odgovora utječu na obim plastičnosti kod riba s različitim amfibijskim navikama (slika 2) ?

Kompromis između izražavanja plastičnih ili neplastičnih, srednjih osobina kada se vodozemne ribe kreću iz vodenog u kopneno stanište. Teorija predviđa da će fenotipski plastični odgovori na promjenu okoliša (npr. prelazak iz vode na kopno) evoluirati kada promjena okoliša traje duže od vremena potrebnog za fiziološke, biokemijske i/ili morfološke promjene (Padilla i Adolph, 1996. Alpert i Simms , 2002 Gabriel et al., 2005 Stomp et al., 2008). Plastični odgovori osiguravaju optimalniju prilagodbu novom okruženju, uprkos visokim energetskim troškovima koji nastaju za proizvodnju i održavanje fenotipa. Alternativno, srednji fenotipovi koji mogu biti manje optimalni u određenom okruženju, ali dovoljno dobri u različitim okruženjima, biće odabrani za situacije u kojima postoji česta ili brza promjena okruženja. Za više detalja pogledajte „Plastičnost – troškovi i ograničenja“ u nastavku.

Kompromis između izražavanja plastičnih ili neplastičnih, srednjih osobina kada se vodozemne ribe kreću iz vodenog u kopneno stanište. Teorija predviđa da će fenotipski plastični odgovori na promjenu okoliša (npr. prelazak iz vode na kopno) evoluirati kada promjena okoliša traje duže od vremena potrebnog za fiziološke, biokemijske i/ili morfološke promjene (Padilla i Adolph, 1996. Alpert i Simms , 2002 Gabriel et al., 2005 Stomp et al., 2008). Plastični odgovori osiguravaju optimalniju prilagodbu novom okruženju, uprkos visokim energetskim troškovima nastalim za proizvodnju i održavanje fenotipa. Alternativno, srednji fenotipovi koji mogu biti manje optimalni u određenom okruženju, ali dovoljno dobri u različitim okruženjima, biće odabrani za situacije u kojima postoji česta ili brza promjena okruženja. Za više detalja pogledajte „Plastičnost – troškovi i ograničenja“ u nastavku.

Iako trenutno ne možemo odgovoriti na mnoga od ovih pitanja, nedavno smo otkrili reverzibilnu plastičnost u lokomotornoj funkciji u rivulusu mangrova. Kryptolebias marmoratus. Performanse skakanja na kopnu dramatično su se poboljšale kod riba koje su aklimatizirane na zraku, imale su niži nivo laktata i povećanu površinu poprečnog presjeka aerobnih mišića u poređenju sa kontrolnim ribama koje su držane u vodi (E. Brunt, A.J.T., G. R. Scott i P.A.W., podneseni). Podsticaj za ove promjene je nepoznat, ali je vjerovatno da će biti dijelom povezan s povećanjem prividne gravitacije, jer K. marmoratus su mirni na kopnu, što bi trebalo da minimizira bilo kakav efekat treninga. Neophodan je daljnji rad kako bi se razumjelo kako reverzibilna plastičnost u lokomotornom ponašanju i morfologiji kod vodozemnih riba koje izranjaju na duži period može dovesti do funkcionalnih poboljšanja na kopnu i da li su mehanizmi očuvani među vrstama.

Neke vodozemne ribe modificiraju kopnenu lokomociju ako se mjesecima uzgajaju izvan vode. Na primjer, kada maloljetni Senegal bichirs (Polypterus senegalus) bili izloženi vlažnom kopnenom staništu 8 mjeseci, razvili su različito oblikovane kosti ključne kosti i kleitruma. Ove promjene su omogućile više prostora za kretanje prsnih peraja u poređenju sa kohortama koje se uzgajaju u vodi, dijelom objašnjavajući njihovu efikasniju lokomociju na kopnu (Standen et al., 2014). Činilo se da nema kompromisa u pogledu vodene lokomocije koju su bičiri podignuti u zrak plivali jednako dobro. Ispitivanje fosilnog zapisa otkrilo je da je ova razvojna plastičnost kod bichira uporedila s makroevolucijskim promjenama koje su bile vidljive kod ranih tetrapoda (Standen et al., 2014). Ovi nalazi pokreću intrigantna pitanja o tome kako su slične plastične reakcije kod drevnih vodozemnih riba mogle igrati ulogu u evoluciji fiksnih lokomotornih osobina kod tetrapoda (vidi „Razvojna plastičnost” u nastavku).


4 DISKUSIJA

4.1 Predatorski događaj i povlačenje

Izvještavamo o jednom događaju predatorstva pauka Damastes sp. jede malu žabu Heterixalus andrakata. Osim toga, primijetili smo tri jedinke iste vrste pauka kako sjede u skloništima napravljenim od zelenih listova pričvršćenih za stabljiku drveta. Povlačenja uglavnom imaju isti oblik. Dva lista bila su ispletena paukovom svilom u vrhu, rubovi i otvoreni u dnu listova izgleda da omogućavaju plijen koji se penje uz stablo drveta da uđe. Čini se da pauci ne preferiraju jednu vrstu drveća, a visina od tla također se čini promjenjiva u odnosu na ta opažanja.

Pauci su najcitiranija grupa beskičmenjaka koja lovi kičmenjake (Barej et al., 2009.). Međutim, većina izvještaja o grabežljivosti vodozemaca od strane beskičmenjaka potiče iz Neotropa. Objavljeno je nekoliko događaja grabežljivaca na afrotropskim anuranima od strane beskičmenjaka (Babangenge et al., 2019.). Izvještaji iz Afrike su iz Tanzanije i Ugande, gdje pauci ribari plijene punoglavce (Vonesh, 2005.), iz Južne Afrike, gdje rakovi pretjeruju na vodozemcima, i iz Kameruna, gdje pauci lutalice plijene žabe (Barej et al., 2009.) . Da li ova geografska pristranost u vezi s grabežljivošću vodozemaca od strane beskičmenjaka zaista odražava razliku u učestalosti takvog ponašanja ili je pristranost posljedica više istraživanja koja se provode u Neotropics (Martin et al., 2012012 Meyer et al., 2015) ostaje, međutim, nejasno. Naše zapažanje je, prema našim saznanjima, drugi izvještaj o grabežljivosti pauka na kralježnjacima sa Madagaskara nakon Glosa (2003), koji izvještava o paucima (Pisauridae) koji se hrane žabama (Heterixalus tricolor) na stabljikama trave trske unutar jezera u suvoj šumi Kirindy.

4.2 Karakteristike Damastes sp. pauci i Heterixalus sp. žabe

Rod Damastes je uključen u porodicu Sparassidae, grupu koja se naziva "pauci lovci" (Rayor, 2018) i javlja se širom svijeta (Jäger, 2012). Većina paukova lovaca ne gradi mreže da bi uhvatila svoj plijen (Rayor, 2018). Umjesto toga, neki od njih su poznati po navici trčanja i lova. Ali, rod Damastes je izuzetak jer pripadnici roda obično koriste pristup sjedi i čekaj (Soutinho et al., 2018). Međutim, neke Sparassidae su pronađene u vlastitom svilenom gnijezdu koje je pričvršćeno krhotinama, ostavljajući listove ili stabljike koje su potpuno okružene svilom (Jackson, 1987.). Nadalje, većina vrsta u porodici Sparassidae su noćne (Rayor, 2018).

Rod Heterixalus je pretežno arborealno i obično se javlja na otvorenim područjima unutar pejzaža kojim dominiraju ljudi (Blommers-Schlösser, 1982 Raharivololoniaina et al., 2003). Vrsta H. andrakata rasprostranjen je na sjevernom i sjeveroistočnom Madagaskaru (Glaw & Vences, 2007.). Tokom našeg ekološkog istraživanja otkrili smo H. andrakata da je uglavnom aktivna noću, ali je u agrošumama zabilježena određena dnevna aktivnost. Međutim, vrsta se obično skriva tokom dana između listova, moguće da bi se izbjegla dehidracija.

4.3 Spekulacije o mogućem sistematskom ponašanju hvatanja

Prethodni izvještaji o paucima koji plijene vodozemce ukazuju na oportunističko ponašanje i ne pružaju dokaze o specijalizaciji. Na osnovu našeg izvještaja, nagađamo da pauci koriste ciljane zamke za plijen vodozemaca. Ovu spekulaciju zasnivamo na nekoliko nizova dokaza. Prvo, neki izvještaji opisuju povlačenje pauka koje pauci koriste kao zaštitu od grabežljivaca (Henschel & Jocqué, 1994 Nentwig & Heimer, 1987 Stradling, 1994 Thirunavukarasu et al., 1996). Međutim, ova povlačenja se također mogu modificirati da služe kao zamka (Nentwig & Heimer, 1987). Drugo, ponašanje je uočeno nezavisno kod četiri jedinke pauka na četiri različita mjesta, što sugerira da zgradu za povlačenje često obavljaju Damastes sp. na severoistoku Madagaskara. Treće, ključni faktor koji olakšava hvatanje u zamku Damastes sp. mozda je to Heterixalus andrakata a možda i druge drvene žabe pokušavaju se sakriti od sunčeve svjetlosti tokom dana kako bi izbjegli dehidraciju (Rodel & Braun, 1999). Kada temperature porastu, žabe traže hlad i pokrivač dalje od tla, što im pauci pružaju u obliku svog povlačenja. Žabe bi mogle preferirati naizgled zaštićene zamke u pokušaju da se sakriju od drugih grabežljivaca kao što su ptice koje skeniraju vegetaciju u potrazi za plijenom. Na osnovu ovih nizova dokaza, nagađamo da vodozemci mogu biti ne samo oportunistički, neselektivni ili slučajni plijen, već prije ciljani, sistematski eksploatisani izvor hrane. Damastes sp. pauci.

Ipak, potrebna su dalja istraživanja kako bi se ovo potvrdilo, posebno zato što izvještavamo samo o jednom opažanju pauka koji se hrani žabom. Osim toga, veća je vjerovatnoća da će veliki plijen, poput žabe, privući pažnju posmatrača, što predstavlja rizik od pretjeranog tumačenja.


Prezentacije

  • Collins, J. P. Agende istraživanja u društvenim aspektima sintetičke biologije. Radionica o istraživačkim agendama u društvenim aspektima sintetičke biologije. Konzorcij za Science Po (novembar 2014).
  • Collins, J. P. Reforma biomedicinskih istraživanja. Forum za reformu biomedicinskih istraživanja. Howard Hughes Medical Institute (oktobar 2014.).
  • Collins, J. P. Proučavanje života u zlatnom dobu: mogućnosti, izazovi i odgovornosti. HHMI uvaženi plenarni predavač, simpozijum dodiplomskih istraživanja, Univerzitet Delaware (avgust 2014.).
  • Collins, J. P. Od biologije do znanosti o životu: tri priče o promjeni i potrebi za vodstvom. 2014 HHMI Professors Orientation, Howard Hughes Medical Institute (jul 2014).
  • Collins, J. P. Dodiplomsko obrazovanje iz biologije početkom 21. stoljeća: Izgradnja argumenta za liderstvo. Američki institut za biološke nauke STEM Faculty Faculty Development Leadership Development Synthesis Meeting, How (apr 2014).
  • Collins, J. P. Radionice na temu "Kreiranje istraživačke agende za ekološke implikacije sintetičke biologije". Radionica o sintetičkoj biologiji, Boston, MA (jan 2014).
  • Collins, J. P. Radionice na temu "Kreiranje istraživačke agende za ekološke implikacije sintetičke biologije". Radionica o sintetičkoj biologiji, Berkeley, Kalifornija (jan 2014).
  • Collins, J. P. Dodiplomsko naučno obrazovanje početkom 21. stoljeća: Čuda nisu potrebna, ali nam trebaju vođe. Samit o budućnosti dodiplomskog obrazovanja geonauke, Univerzitet Teksas, Ostin, Teksas (jan 2014).
  • Collins, J.P. je pozvan komentator na temu "Okruženje u kutijama-stakleno posuđe i uspon ekološkog razmišljanja". Godišnji sastanak Društva istorije nauke, Boston, MA (dec 2013).
  • Collins, J.P. pozvani komentator, sesija na temu "Organizmi u promjenjivim okruženjima: koncepti i konteksti prilagodljivosti u biljnim naukama 20. stoljeća". Godišnji sastanak Društva istorije nauke, Boston, MA (dec 2013).
  • Collins, J.P. Biologija se mijenja: mogućnosti, transformacije i izazovi. Vijeće Američkog instituta za biološke nauke, sastanak o liderstvu u biologiji, Washington, DC (dec 2013).
  • Collins, J.P. Scoping sastanak na temu "Omogućavanje arhitekture za sljedeću generaciju istraživanja prirodnih nauka". Nacionalna akademija nauka, Odbor za nauke o životu (oktobar 2013).
  • Collins, J.P. Jedna biologija, jedna nauka: popunjavanje praznina između disciplina. Uvodni govornik, Treća bijenala Zapadna regionalna IDeA naučna konferencija, Honolulu, HI (2013) (oktobar 2013).
  • Collins, J.P. Dodiplomsko obrazovanje za biologiju početkom 21. stoljeća: Čuda nisu potrebna, ali nam trebaju vođe. Vizija i promjena u biološkom dodiplomskom obrazovanju II (avg 2013).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu: globalni pad vodozemaca. Univerzitet Georgetown (april 2013).
  • Collins, J.P. Istorija i pregled hitridiomikoze. Nacionalni centar za ekološku analizu i sintezu, Radionica na temu "Fungal pathogen" (mar 2013).
  • Collins, J.P. Evolucija biologije i Istraživački univerzitet 21. stoljeća. Istraživačko vijeće Državnog univerziteta New York (SUNY), Istraživačka fondacija za SUNY, SUNY Global (dec 2012).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu. Globalni pad vodozemaca. Predavanje na koledžu St. Olaf (oktobar 2012).
  • Collins, J.P. Kreativno rješavanje problema iz interdisciplinarne perspektive. Kolokvijum o inovacijama u slobodnim umetnostima na koledžu S. Olaf (oktobar 2012).
  • Collins, J.P. Interdisciplinarni programi preoblikuju ulogu biologije u naučnom obrazovanju. Sastanak direktora programa i profesora Medicinskog instituta Howard Hughes (oktobar 2012).
  • Collins, J.P. Liderski izazovi na više nivoa: Inoviranje usred izvrsnosti. NSF/HHMI/NIH partnerstva u dodiplomskom obrazovanju prirodnih nauka (PULSE) Inauguralni sastanak stipendista, (oktobar 2012).
  • Collins, J.P. i B.A. Minteer. Ekološka etika i invazivne vrste u vremenu globalnih promjena. 7. Svjetski herpetološki kongres, Vancouver, Kanada (avg 2012).
  • Langhammer, P.F., P.A. Burrowes, A.B. Bryant, K.R. Lips i J.P. Collins. Hitridiomikoza kod žabe koja se direktno razvija: ontogenetska osjetljivost, prijenos patogena i utjecaj chytrid gljive na populacijskom nivou u Eleutherodactylus coqui. 7. Svjetski herpetološki kongres, Vancouver, Kanada (avg 2012).
  • Collins, J.P. O kriterijima zasluga NSF-a za transformativno istraživanje. "Zašto želimo da nauka bude revolucionarna i da li bismo to trebali?" Istorija morske biološke laboratorije (jul 2012).
  • Collins, J. P. Interdisciplinarni programi preoblikuju ulogu biologije u naučnom obrazovanju. 26. godišnja ljetna radionica BioQUEST Curriculum Consortium na temu "Pravljenje razlike pomoću podataka", Gouch (jun 2012).
  • Collins, J.P. Interdisciplinarni programi preoblikuju ulogu uvodne biologije u naučnom obrazovanju. "Introductory Biology Project Summer Conference", Američko udruženje za unapređenje nauke (jun 2012).
  • Collins, J.P. Premošćivanje ideala i smisla politike transformativnog istraživanja. Radionica o "Potencijalno transformativnom istraživanju: društvene i etičke implikacije", Nacionalna nauka (mar 2012).
  • Collins, J.P. Jedna biologija, jedna nauka: vizija za 21. vijek. Phi Beta Kappa Lifto Amundson predavanje, Univerzitet Južne Dakote (mar 2012).
  • Collins, J.P. Implikacije transformacija u naučnu praksu. Godišnji sastanak Američkog udruženja za unapređenje nauke (febr. 2012).
  • Collins, J.P. Implikacije transformacija u naučnoj praksi. Simpozijum Američkog udruženja za unapređenje nauke na temu „Interdisciplinarna saradnja: I (febr. 2012).
  • Collins, J.P. Učenje i otkriće u eri promjena. Konferencija američkog udruženja koledža i univerziteta o obrazovanju i ocjenjivanju: „Leaning and (feb 2012).
  • Hyman, O.J. i J.P. Collins. Životni stadij i sezonske varijacije u prevalenciji Batrachochytrium dendrobatidis u žabama Boreal Chorus. Trenutna istraživanja o herpetofauni pustinje Sonora V (novembar 2011).
  • Hyman, O.J. i J.P. Collins. Uloga okoliša u gubitku chytrid (Bd) infekcija kod Arizona chorus žaba. Wildlife Society, Hawaii (novembar 2011).
  • Collins, J. P. Uvodne i završne napomene o "Promjeni ljudi u okruženju koje se mijenja", Nacionalno udruženje nastavnika biologije. Američki institut bioloških nauka i simpozijum Nacionalnog centra za evolucionu sintezu (oktobar 2011).
  • Collins, J.P. Jedna biologija, jedna nauka: vizija za 21. vek. Obraćanje predsjednika naučnog simpozijuma, Bowdoin College (oktobar 2011.).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu: Globalni pad vodozemaca. Pozvani govornik, Cornerstones of Science Lectures, Curtis Memorial Library, Brunswick, Maine (oktobar 2011.).
  • Hyman, O.J. i J.P. Collins. Batrachochytrium dendrobatidis u borealnim horus žabama: Životni stadij i sezonske varijacije u prevalenciji endemskog patogena. Godišnji sastanak Ekološkog društva Amerike, Austin, TX (avg 2011).
  • Collins, J.P. Prirodna selekcija i ekološka teorija. 25. Altenbergova radionica teorijske biologije (jul 2011).
  • Collins, J.P. Otvaranje novih horizonata za biologiju velikih razmjera: Nacionalna ekološka opservatorijska mreža ili NEON. Američko društvo za istoriju životne sredine (april 2011).
  • Collins, J.P. Interdisciplinarni programi preoblikuju ulogu biologije u naučnom obrazovanju. Forum na temu "Istraživanja u biološkom obrazovanju" Institut za res. o matematici i nauci. Educ, MSU (april 2011).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu. Globalni pad vodozemaca. Sastanak mreže za procjenu i praćenje tropske ekologije, Dar es Salaam (april 2011.).
  • Collins, J.P. Otvaranje novih horizonata za biologiju velikih razmjera: Nacionalna ekološka opservatorijska mreža. Panel na temu "Uzimanje pulsa Zemlje": Američko društvo za istoriju životne sredine (mar 2011).
  • Collins, J. P. Financiranje istraživanja na granicama disciplina. Simpozijum na temu "Nauka o vatri: Facilitiranje interdisciplinarnog istraživanja i obrazovanja" (mart 2011).
  • Collins, J. P. Liderski izazovi na više nivoa. Simpozijum na temu "Nauka o vatri: Facilitiranje interdisciplinarnog istraživanja i obrazovanja" (mart 2011).
  • Collins, J.P. Korištenje multidisciplinarnih i interdisciplinarnih programa za suočavanje s promjenama u znanostima o životu. Sastanak za vezu ureda nezavisnih koledža, Washington, DC (feb 2011).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu. Globalni pad vodozemaca. Univerzitet Yale (jan 2011).
  • Zillmann, A.M., O.J. Hyman, J.P. Collins i V.H. Smith. Ima li željezo ulogu u dinamici nastajanja zarazne bolesti? Godišnji sastanak Društva za integrativnu i komparativnu biologiju (jan 2011).
  • Hyman, O.J. i J.P. Collins. Batrachochytrium dendrobatidis u Arizoni: detekcija filtracijom vode i utjecaj kemije vode na dinamiku Bd. Godišnji sastanak Radne grupe za populaciju vodozemaca u Kaliforniji/Nevadi 2011. (jan 2011.).
  • Collins, J.P. "Liderstvo u vremenu nauke i inženjerstva bez granica". Keck fondacija/PKAL (Projekt Kaleidoskop) Nacionalni kolokvijum o "Transformativnim promjenama u STEM Edu" (oktobar 2010.).
  • Collins, J.P. "Podučavanje procesa otkrivanja u svijetu koji se brzo mijenja". Simpozijum Medicinskog instituta Howard Hughes na temu „BIO 2020: Razvoj sljedeće generacije. Transformacija (avgust 2010.).
  • Hyman, O. i J.P. Collins. 2010. Sažetak. Negativan utjecaj fosfora na prevalenciju patogena koji ubija žabe, Batrachochytrium dendrobatidis. Godišnji sastanak Američkog društva ihtiologa i herpetologa, Providence, RI (avg 2010).
  • Collins, J.P. Otvorena diskusija. Radionica na temu "Univerzitet 21. veka", Wissenschaftskolleg zu Berlin/Institut za napredovanje (jun 2010).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu. Globalni pad vodozemaca. Seminar Odsjeka za evoluciju i biologiju organizma Harvard univerziteta (april 2010.).
  • Collins, J.P. Uloga zarazne bolesti u opadanju i izumiranju vodozemaca. Univerzitet Tennesseeja, Knoxville, Odsjek za šumarstvo, divlje životinje i ribarstvo, Centar za divlje životinje (april 2010.).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu. Globalni pad vodozemaca. Univerzitet Tennesseeja, Odsjek za ekologiju i evolucijsku biologiju (april 2010.).
  • Collins, J.P. Izumiranje u našem vremenu. Global amphibian decline. Association of Zoos and Aquariums, Mid-Year Conference (Mar 2010).
  • Collins, J.P. Biological sciences in the 21st century. Science and engineering without borders. University of Oklahoma (Mar 2010).
  • Collins, J.P. Extinction in our times. Global amphibian decline. US Fish & Wildlife Service Southwest Region conference on "Climate change and the conservation of na (Mar 2010).
  • Collins, J.P. Extinction in our times. Global amphibian decline. Distinguished Lecturer in Life Science, Huck Institutes of the Life Sciences, Penn State University (Feb 2010).
  • James Collins. Amphibian chytrid fungal disease and global amphibian decline. Workshop on "Genomics-based research for understanding extinction with conservation applications" Sa (Dec 2009).
  • Collins, J.P. Reassembling the pieces: Biological systems and systems biology. Symposium on understanding complexity in biological sciences. History of Science Society, Phoenix, AZ (Dec 2009).
  • James Collins. Moving forward with large biology initiatives: The human connectome project. National Academy of Sciences, Institute of Medicine, Forum on Neuroscience and Nervous System Disord (Nov 2009).
  • James Collins. Investing in high risk, high reward research. U.S. House of Representatives Committee on Science and Technology Subcommittee on Research and Scien (Oct 2009).
  • James Collins. Biological sciences in the 21st century. Science and engineering without borders. NSF EPSCoR (Experimental Program to Stimulate Competitive Research) 21st National Conference (Oct 2009).
  • James Collins. Environmental sciences in the 21st century. Looking back and looking forward. 25th Anniversary Celebration of the Board on Life Sciences" National Academy of Sciences, National R (Oct 2009).
  • James Collins and Judith St. John. National Plant Genome Initiative. 12th Annual Meeting Plant Genome Research Program (Sep 2009).
  • James Collins. 30 years and counting for LTER: Innovating in the midst of excellence. Long Term Ecological Research All Scientists Meeting, Estes Park, CO (Sep 2009).
  • James Collins. The causes of amphibian declines and extinctions: What do we know and what do we need to learn?. Zoological Society London: Amphibian Mini-Summit (Aug 2009).
  • James Collins. Biological Sciences in the 21st Century: Priorities and opportunities. National Institute for Standards and Technology lecture (Aug 2009).
  • Minteer, B.A. and J.P. Collins. Managed relocation. Conservation, ecological ethics and planetary change. Annual meeting of the Ecological Society of America, Albuquerque, NM (Aug 2009).
  • James Collins. One biology, One science: A vision for 21st century biology. Mount Desert Island Biological Laboratory (Jul 2009).
  • James Collins. One biology, One science: A vision for 21st century biology. Hubbard Brook Research Foundation Annual Meeting (Jul 2009).
  • James Collins. Does the biology we teach reflect the biology we do? A view for the 21st century. American Association for the Advancement of Science conference (Vision and change in undergraduate b (Jul 2009).
  • James Collins. Extinction in our times. Global amphibian decline. Smithsonian Institution National Museum of Natural History (Jun 2009).
  • James Collins. Extinction in our times. Global amphibian decline. Association of Zoos and Aquariums, Directors Washington Policy Conference (May 2009).
  • James Collins. Extinction in our times. Global amphibian decline. University of Wisconsin-Madison - Kaesar Visiting Scholar Lecture (Apr 2009).
  • James Collins. One biology, One science: A vision for 21st century biology. University of Wisconsin seminar (Apr 2009).
  • James Collins. National Ecological Observatory Network. Opening new horizons for large-scale biology. University of Missouri, Columbia (Apr 2009).
  • James Collins. One biology, One science: A vision for 21st century biology. University of Missouri, Columbia (Apr 2009).
  • James Collins. Extinction in our times. Global amphibian decline. National Science Foundation, Earth Month Keynote Speaker (2009) (Apr 2009).
  • James Collins. One biology, One science: A vision for 21st century biology. Florida Institute for Human and Machine Cognition Evening Lecture Series (Apr 2009).
  • James P. Collins. Ten million places at the table: Translating biodiversity issues from science to policy. National Academy of Sciences Darwin Birthday Symposium (Twenty-first century ecosystems) (Feb 2009).
  • James Collins. A modern extinction event: The science, ethics, and policy implications of global amphibian decline. Departmental seminar at University of Washington, Seattle (Jan 2009).
  • Collins, J.P. and J. St. John. The National Plant Genome Initiative: Third Five Year Plan (2009-2013). Plant & Animal Genome XVII, San Diego, CA (Jan 2009).
  • Collins, J.P. Biology in the 21st Century: Microbial Genome Sequencing Program. Plant & Animal Genome XVII, San Diego, CA (Jan 2009).
  • James Collins. "One biology, one science". Annual Meeting The American Society for Cell Biology (Dec 2008).
  • James Collins. Global amphibian declines: Where we are and where to from here. 9th National Conference on Science, Policy and the Environment. National Council for Science and the (Dec 2008).
  • James Collins. Cyber-enabled research observatories: New horizons in Earth observation. GEO-V: Fifth Plenary of the Group on Earth Observations, Bucharest, Romania (Nov 2008).
  • Schock, D.M., D.G. Allaire, S. Carri re, J.P. Collins, R.J. Gau, G. Guthrie, N.C. Larter, R. Popko, G. Ruthig, D.P. Tate, A.Veitch. Amphibians of the Dehcho and Sahtu Regions of the Northwest Territories, Canada. Annual meeting Committee on the Status of Endangered Wildlife in Canada (Sep 2008).
  • James Collins. "Interdisciplinary climate change research at NSF". NSF-NSF/China workshop on climate change, Shanghai, China (Sep 2008).
  • James Collins. "Interdisciplinary climate change research at NSF". NSF-Chinese Academy of Sciences workshop on climate change, Xianjiang University, Urumqi, Xinjiang P (Sep 2008).
  • James Collins. "One biology, one science: A vision for 21st century biology". The 2008 US National Academies Biology Summit on "The role of the life sciences in transforming Amer (Sep 2008).
  • James Collins. "The view of NEON from NSF". Annual Meeting Ecological Society of America (Aug 2008).
  • James Collins. Concluding remarks: Symposium on "Amphibian conservation: Moving from global to regional.". Sixth World Congress of Herpetology, Manaus, Brazil (Aug 2008).
  • James Collins. "One biology, one science". Society for Developmental Biology (Jul 2008).
  • James Collins. "One biology, one science". International Conference on Arabidopsis Research (Jul 2008).
  • James Collins. "One biology, one science". Annual Meeting American Society of Microbiologists (Jun 2008).
  • James Collins. "Global change is life in transition". Annual Meeting North American Benthological Society (May 2008).
  • James Collins. "Environmental research and education activities at NSF". Council of Environmental Deans and Directors Biannual meeting (Feb 2008).
  • James Collins. "Understanding the brain through neuroinformatics". Swedish Embassy program (Feb 2008).
  • James Collins. A modern extinction event: The science, ethics, and policy implications of global amphibian decline. University of Maryland departmental seminar (Feb 2008).
  • James Collins. A modern extinction event: The science, ethics, and policy implications of global amphibian decline. Departmental seminar at University of California, San Diego (Jan 2008).
  • James Collins. Concluding remarks, The National Plant Genome Initiative. Interagency Working Group on the Plant Genome ProgramPlant & Animal Genome XVI, San Diego, CA (2008) (Jan 2008).
  • Picco, A.M. and J.P. Collins. Management for controlling the spread of amphibian diseases through trade. Annual meeting of the California-Nevada Amphibian Populations Task Force (Jan 2008).
  • Picco, A, Collins, James. Transport and emergence of infectious diseases through commerce: the bait trade as a model system. EcoHealth ONE Conference (Oct 2006).
  • Collins, James. Students becoming scientists in the world: Integrating research and education for sustainable development. United Nations University Institute of Advanced Studies and UNESCO conference (Sep 2006).
  • Collins, James. The LTER network: Past, present?and future. Long Term Ecological Research Network All Scientists Meeting (Sep 2006).
  • Collins, James, Minteer, B. Ecological ethics and scientific assessments. Ecological Society of America (Aug 2006).
  • Greer, A, Collins, James. Spatial and temporal variation in Ambystoma tigrinum virus (ATV) infection prevalence in a persisting Ambystoma tigrinum population on the Kaibab Plateau, AZ. Ecological Society of America (Aug 2006).
  • Picco, A, Collins, James. Human-mediated spread of amphibian pathogens through the tiger salamander bait trade. Ecological Society of America (Aug 2006).
  • Fox, S, Torres-Cervantes, R, Storfer, A, Parra, G, Greer, A, Collins, James. Ranavirus and Batrachochytrium dendrobatidis in endangered and diseased populations of the frog Atelognathus patagonicus in northern Patagonia, Argentina. Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists (Jun 2006).
  • Lips, K, Brem, F, Brenes, R, Reeve, James, Alford, R, Carey, C, Livo, L, Pessier, A, Collins, James. Emerging infectious disease and the loss of biodiversity in a Neotropical amphibian community. Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists (Jun 2006).
  • Collins, James, Brunner, J, Greer, A, Miera, V, Picco, A, Retallick, R, Schock, D. A comparison of the biology of emerging infectious diseases caused by chytrid fungus (Batrachochytrium dendrobatidis) and ranaviruses in tropical and temperate habitats. Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists (Jun 2006).
  • Collins, James. Keynote address on undergraduate education and research. Undergraduate Research Symposium (Feb 2006).
  • Collins, James. Biology as a bridge to the future. Society for Molecular Biology and Evolution (Feb 2006).
  • Miera, V, Retallick, R, Collins, James, Davidson, E. Host-pathogen ecology of an amphibian community on the Mogollon Rim. Symposium on Current Research of the Herpetofauna of the Sonoran Desert III (Oct 2005).
  • Schock, D, Chinchar, V, Bollinger, T, Collins, James. Amphibian ranaviruses cause morbidity and mortality in multiple species. Symposium on Current Research of the Herpetofauna of the Sonoran Desert III (Oct 2005).
  • Collins, James. Introductory and closing remarks. Quality Education for Minorities Network Workshop (Oct 2005).
  • Collins, James, Sullivan, B. Jack Fouquette and Arizona herpetology. Symposium on Current Research of the Herpetofauna of the Sonoran Desert III (Oct 2005).
  • Collins, James. Integrated research challenges in environmental biology: An international collaborative research project. National Council of University Research Administrators, Region 6 (Sep 2005).
  • Collins, James. School of Life sciences and interdisciplinary resaerch. Southwest Consortium for Theoretical, Mathematical, and Computational Biology (Sep 2005).
  • Collins, James. Closing remarks. Western Regional Bioethics Conference (Sep 2005).
  • Bolker, B, de Castro, F, Storfer, A, Harvey, E, Collins, James. Modeling interactions between cannibalism and disease in tiger salamanders. Ecological Society of America (Aug 2005).
  • Collins, James. The chytrid fungus, Batrachotrium dendrobatidis, as a cause of amphibian declines. XI Congress of Mycology at the International Union of Microbial Societies (Aug 2005).
  • Fox, S, Greer, A, Torres-Cervantes, R, Collins, James. First case of ranavirus-associated morbidity and mortality in natural populations of a South American amphibian: occurrence and effects. Annual meeting Southwestern Association of Naturalists (Aug 2005).
  • Collins, James. Ranaviruses as emerging disease threats to amphibian populations. 5th World Congress of Herpetology (Jun 2005).
  • Collins, James, Minteer, B. Ecological ethics: Building a new tool kit for ecologists and biodiversity managers. Conference on Environmental ethics, science and policy, Department of Philosophy (Apr 2005).
  • Collins, James. What does it mean to be an educated member of the science, technology, engineering, and math workforce in the 21st century?. Workshop, President's Office (Mar 2005).
  • Collins, James. Leadership in building an interdisciplinary learning environment. Project Kaleidoscope (Feb 2005).
  • Collins, James. Current research in the host-pathogen biology of amphibians and chytrids. XI Congress of Mycology at the International Union of Microbial Societies
  • Collins, James. Conference on Environmental ethics, science and policy, Department of Philosophy
  • Collins, James. Faculty leader for Project Kaleidoscope: "Leadership in building an interdisciplinary learning environment"
  • Collins, James. National Council of University Research Administrators, Region 6
  • Collins, James. Southwest Consortium for Theoretical, Mathematical, and Computational Biology
  • Collins, James. Symposium on "Amphibian declines" 5th World Congress of Herpetology
  • Collins, James. Western Regional Bioethics Conference
  • Collins, James. What does it mean to be an educated member of the science, technology, engineering, and math workforce in the 21st century?. President's Office
  • Collins, James. Quality Education for Minorities Network Workshops
  • Collins, James. Society for Molecular Biology and Evolution
  • Collins, James. Dodiplomski istraživački simpozij
  • Collins, James. Workshop to design an amphibian monitoring program for the Tropical Ecology Assessment and Monitoring Network (TEAM), Conservation International
  • Collins, James. Future directions in tropical research. Organization for Tropical Studies Assembly of Delegates Meeting
  • Collins, James. Globalization: Challenges and opportunities for science and technology. United Nations University Institute of Advanced Studies and UNESCO
  • Collins, James. Issues related to Biology Directorate programs. NSF
  • Collins, James. Scientific assessments as upstarts in ecology: ethical considerations for ecologists. Annual Meeting, Ecological Society of America
  • Collins, James, Minteer, Ben. Ecological ethics: examining the neglected ethical context of ecological decision-making. Annual Meeting, Ecological Society of America
  • Collins, James. Amphibian metamorphosis: 30 years of progress. Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists
  • Collins, James. Biology and Society programs: Preparing students for biology in social context. Biannual meeting of the International Society for the History, Philosophy, and Social Studies of Bio
  • Collins, James. Education and broader impacts. Development of a national systematics infrastructure: A virtual instrument for the 21st
  • Collins, James. Education and broader impacts. New York Botanical Garden workshop on "Development of a national systematics infrastructure: A virtual instrument for the 21st century"
  • Collins, James. Evolutionary ecology of a model salamander-virus system. Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists
  • Collins, James. Evolutionary ecology of a model salamander-virus system. Annual meeting of the Research and Analysis Network for Neotropical Amphibians
  • Collins, James. From metamorphosis to eco-devo. Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists
  • Collins, James. Human dimensions of ecology. Biannual meeting of the International Society for the History, Philosophy, and Social Studies of Bio
  • Collins, James. Population-level differences in susceptibility to lethal ranaviruses in two Canadian tiger salamande. Annual meeting of the Southwestern United States working group of the Declining Amphibian Population
  • Collins, James. Susceptibility of salamanders and frogs to chytrid infections. Annual meeting of the Southwestern United States working group of the Declining Amphibian Population
  • Collins, James. The ecology of a tiger salamander ranavirus. Annual meeting of the Southwestern United States working group of the Declining Amphibian Population
  • Collins, James. The importance of a complex life history in the long-term persistence of a lethal virus in seasonall. Ecological Society of America
  • Collins, James. Variation in ranavirus strains in western North America. Annual meeting of the Southwestern United States working group of the Declining Amphibian Population
  • Collins, James. W.L. Minckley: Scholar, mentor, friend. Annual meeting, Desert Fishes Council
  • Collins, James, Whitmer, Ali. Biology and Society programs: Preparing students for biology in social context. Biannual meeting of the International Society for the History, Philosophy, and Social Studies of Science
  • Allison, L, Collins, James, Averill-Murray, R. Proportion area occupied: Using historical data for an endangered tiger salamander to design an effective monitoring strategy. Ecological Society of America
  • Brunner, J, Collins, James. Replication rates, virulence, and virus by host interactions in tiger salamander ranaviruses. Ecological Society of America
  • Collins, James.
  • Collins, James. Closing comments. Gordon Conference on "Science and technology policy: Who wins, who loses, who cares?"
  • Collins, James. Creating interdisciplinary programs in the Biology Department at ASU. Arizona State University Department of Physics and Astronomy retreat
  • Collins, James. Forecasting changes in amphibian biodiversity: aiming at a moving target. The Royal Society meeting on Beyond extinction rates: monitoring wild nature for the 2010 target
  • Collins, James. Perspectives on education and training: Creating a new generation of interdisciplinary researchers. U.S. National Academies of Sciences Convocation on Facilitating Interdisciplinary Research
  • Collins, James. Science and technology policy: Who wins, who loses, who cares?. Gordon Conference
  • Collins, James. Studying pathogens and global amphibian declines by integrating research projects, programs, and networks. Washington State University/University of Idaho
  • Collins, James, Halliday, T. Forecasting changes in amphibian biodiversity: aiming at a moving target. The Royal Society, London, Scientific Discussion meeting (Beyond extinction rates: monitoring wild n
  • Fox, S, Torres-Cervantes, R, Collins, James. La conservaci n de una rana amenazada (Atelognathus patagonicus) en la Patagonia, Aegentina: Efectos de la depredaci n de un pez ex tico, una infecci n pathol gica, y su interacci n. Annual meeting of the Research and Analysis Network for Neotropical Amphibians
  • Greer, A, Fox, S, Torres-Cervantes, R, Davidson, E, Collins, James. Evidence for a ranavirus pathogen in the endangered frog, Atelognathus patagonicus, in Patagonia, Argentina. Annual meeting of the Research and Analysis Network for Neotropical Amphibians
  • Jancovich, J, Bremont, M, Touchman, J, Kumar, S, Valente, G, Storfer, A, Davidson, E, Collins, James, Jacobs, B. Genomic sequence of epizootic haematopoetic necrosis virus (EHNV): An evolutionary link between frog and salamander ranaviruses?. XI International Pox and Iridovirus Symposium
  • Jancovich, J, Davidson, E, Parameswaran, N, Mao, J, Chinchar, V, Collins, James, Jacobs, B, Storfer, A. Emergence of an amphibian disease due to human-enhanced spread. Annual meeting of the Research and Analysis Network for Neotropical Amphibians
  • Schock, D, Bollinger, T, Collins, James. Large-scale differences in disease susceptibility among populations of tiger salamanders in Saskatchewan and Manitoba. 9th Annual Meeting of The Canadian Amphibian & Reptile Conservation Network
  • Schock, D, Bollinger, T, Collins, James. Large-scale differences in disease susceptibility in an anphibian-virus system. Ecological Society of America
  • Schock, D, Chinchar, V, Bollinger, T, Collins, James. Saskatchewan ranaviruses cause mortality & sub-lethal infections in multiple amphibian species. 9th Annual Meeting of The Canadian Amphibian & Reptile Conservation Network
  • Collins, James. What is integrative biology at the start of the 21st century?. Annual meeting, Society for Integrative and Comparative Biology
  • Picco, A, Collins, James. Amphibian pathogen movement through the bait trade in North America. Annual meeting of the California-Nevada Amphibian Populations Task Force
  • Schock, D, Bollinger, T, Chinchar, V, Jancovich, J, Collins, James. Experimental evidence that amphibian ranaviruses are multi-host pathogens. Annual meeting of the California-Nevada Amphibian Populations Task Force
  • Collins, James. Life Sciences Symposium on "Reorganization of life science instruction and research"
  • Collins, James. Partners in Amphibian and Reptile Conservation research symposium, Ann. Meet. Amer. Soc. Ichthyologists and Herpetologists
  • Collins, James. Thomas S. Hall Lecture
  • Collins, James. Amphibian declines: untangling the complexity. American Association for the Advancement of Science (AAAS)
  • Collins, James. Amphibian Declines: Untangling the complexity. Annual Meeting, American Association for the Advancement of Science
  • Collins, James. Host-pathogen biology and amphibian declines. American Society of Ichthyologists and Herpetologists
  • Collins, James. Host-pathogen biology and the global decline of amphibians: NSF's role. Annual meeting of the Southwestern United States working group of the Declining Amphibian Populations Task Force
  • Collins, James, Harvey, E. Conspecific environment and life history variation in Ambystoma tigrinum nebulosum. American Society of Ichthyologists and Herpetologists
  • Collins, James, Jancovich, J, Davidson, E, Chinchar, V. The current status of salamander ranaviruses in Western North America. National Heritage Trust (Australia) conference on amphibian diseases
  • Collins, James, Storfer, A. The Complexity of Amphibian Declines: A Case Study. Annual Meeting, American Association for the Advancement of Science
  • Davidson, E, Pessier, A, Longcore, J, Parris, M, Jancovich, J, Brunner, J, Schock, D, Collins, James. Chytridiomycosis in Arizona (USA) tiger salamanders. National Heritage Trust (Australia) conference on amphibian diseases
  • Jancovich, J, Davidson, E, Collins, J, Collins, James. Molecular biology of North American ranaviruses. XIIIth International Poxvirus and Iridovirus Symposium
  • Brunner, J, Schock, D, Collins, James, Davidson, E. Differential susceptibility of larval and metamorphosed tiger salamanders to a lethal virus. Joint annual meetings Herpetologists' League and Society for the Study of Amphibians and Reptiles
  • Collins, James. The Southwest and Rocky Mountain (SWARM) region of the American Association for the Advancement of Science (AAAS) annual meeting
  • Collins, James. Declining amphibian populations of California and Nevada: Causes and solutions. Western Section of The Wildlife Society
  • Collins, James. Planning for this century: The first Transect seminar.
  • Collins, James. The great amphibian die-off: Why?. The Council for the Advancement of Science Writing, a national association of science writers, editors, and broadcasters
  • Davidson, E, Jancovich, J, Collins, James. Iridovirus disease in salamanders. American Fisheries Society
  • Jancovich, J, Davidson, E, Collins, James, Parameswaren, N, Jacobs, B. Molecular biology of ranaviruses isolated from Arizona salamanders. 20th Annual Meeting American Society for Virology

You are here

My primary research interest is the study and evaluation of evolutionary processes and we work mostly on reptile and frog systems because they are the animals I know the most about. My research interests and those of the group are quite broad. We 'concentrate' on four main research areas: molecular phylogenetics at all scales, comparative evolutionary biology, behavioural and molecular ecology, and natural history and conservation biology. Of course there is overlap between these research themes, particularly in some of the molecular methods used to tackle questions. What we do in each of these areas are described on my lab web site and have a look through our publications to get a better feel for what my group does.

For more information on our lab you can go to these links:

Visiting Fellow

PhD Students

  • Yu-Ying Luo
  • Siwanon Paphatmethin
  • Carlos Pavon Vazquez
  • Sarin (Putter) Tiatragul

Postdoctoral Fellows

  • Ian Brennan
  • Damien Esquerre
  • Mitzy Pepper
  • Ben Scheele

Divisional Visitors

  • Hannah Gerke
  • Geoffrey Kay
  • Maxine Piggott
  • Danswell Starrs

Group Leader


Modern Amphibians

Amphibians can be divided into three groups: Urodela (salamanders), Anura (frogs), and Apoda (caecilians).

Ciljevi učenja

Differentiate among the orders of amphibians

Key Takeaways

Ključne točke

  • Adult salamanders usually have four limbs and a tail, moving by lateral undulation in a fish-like manner while “walking” their arms and legs forward and back.
  • The majority of salamanders are lungless respiration occurs through the skin or through external gills some terrestrial salamanders have primitive lungs a few species have both lungs and gills.
  • Salamanders utilize internal fertilization after males transfer sperm to the eggs via the spermatophore there is a prolonged egg phase metamorphosis occurs before hatching.
  • Caecilians are blind, limbless vertebrates that resemble earthworms and are adapted for a soil-burrowing or an aquatic lifestyle.
  • Adult frogs use their hind legs to jump they fertilize externally, laying their shell-less eggs in moist environments.
  • Tadpoles (the larval stage of a frog) have gills, a lateral line system, long-finned tails, and lack limbs when tadpoles become adults, gills, tails, and the lateral line disappear, while an eardrum and lungs develop.

Key Terms

  • lateral undulation: movement by bending the body from side to side
  • spermatofora: a capsule or mass created by males, containing sperm and transferred in entirety to the female during fertilization
  • metamorfoza: a change in the form and often habits of an animal after the embryonic stage during normal development

Modern Amphibians

Amphibia comprises an estimated 6,770 extant species that inhabit tropical and temperate regions around the world. Amphibians can be divided into three clades: Urodela (“tailed-ones”), the salamanders Anura (“tail-less ones”), the frogs and Apoda (“legless ones”), the caecilians.

Salamanders: Most salamanders have legs and a tail, but respiration varies among species.

Urodela: Salamanders

Salamanders are amphibians that belong to the order Urodela. Living salamanders include approximately 620 species, some of which are aquatic, other terrestrial, and some that live on land only as adults. Adult salamanders usually have a generalized tetrapod body plan with four limbs and a tail. They move by bending their bodies from side to side, called lateral undulation, in a fish-like manner while “walking” their arms and legs back and forth. It is thought that their gait is similar to that used by early tetrapods. Respiration differs among the species. The majority of salamanders are lungless, with respiration occurring through the skin or through external gills. Some terrestrial salamanders have primitive lungs a few species have both gills and lungs.

Unlike frogs, virtually all salamanders rely on internal fertilization of the eggs. The only male amphibians that possess copulatory structures are the caecilians, so fertilization among salamanders typically involves an elaborate and often prolonged courtship. Such a courtship allows the successful transfer of sperm from male to female via a spermatophore. Development in many of the most highly-evolved salamanders, which are fully terrestrial, occurs during a prolonged egg stage, with the eggs guarded by the mother. During this time, the gilled larval stage is found only within the egg capsule, with the gills being resorbed, and metamorphosis being completed, before hatching. Hatchlings resemble tiny adults.

Frogs: The Australian green tree frog is a nocturnal predator that lives in the canopies of trees near a water source.

Anura: Frogs

Frogs are amphibians that belong to the order Anura. Anurans are among the most diverse groups of vertebrates, with approximately 5,965 species occurring on all of the continents except Antarctica. Anurans have a body plan that is more specialized for movement. Adult frogs use their hind limbs to jump on land. Frogs have a number of modifications that allow them to avoid predators, including skin that acts as camouflage. Many species of frogs and salamanders also release defensive chemicals that are poisonous to predators from glands in the skin.

Frog metamorphosis: A juvenile frog metamorphoses into a frog. Here, the frog has started to develop limbs, but its tadpole tail is still evident.

Frog eggs are fertilized externally. As with other amphibians, frogs generally lay their eggs in moist environments. This is required as eggs lack a shell and will dehydrate quickly in dry environments. Frogs demonstrate a great diversity of parental behaviors: some species lay many eggs and exhibit little parental care other species carry eggs and tadpoles on their hind legs or backs. The life cycle of frogs, as with other amphibians, consists of two distinct stages: 1) the larval stage followed by 2) metamorphosis to an adult stage. The larval stage of a frog, the tadpole, is often a filter-feeding herbivore. Tadpoles usually have gills, a lateral line system, long-finned tails, and lack limbs. At the end of the tadpole stage, frogs undergo metamorphosis into the adult form. During this stage, the gills, tail, and lateral line system disappear, and four limbs develop. The jaws become larger and are suited for carnivorous feeding, while the digestive system transforms into the typical short gut of a predator. An eardrum and air-breathing lungs also develop. These changes during metamorphosis allow the larvae to move onto land in the adult stage.

Apoda: Caecilians

An estimated 185 species comprise caecilians, a group of amphibians that belong to the order Apoda. Although they are vertebrates, a complete lack of limbs leads to their resemblance to earthworms in appearance. They are adapted for a soil-burrowing or aquatic lifestyle they are nearly blind. These animals are found in the tropics of South America, Africa, and Southern Asia. They have vestigial limbs which is evidence that they evolved from a legged ancestor.


Pogledajte video: Biologija, 4. r. SŠ - Biološka evolucija filogenetski razvoj života (Oktobar 2022).